协议搬迁进行征地是不合法的。因为征地拆迁行为是一种行政行为，有国家的法律法规及地方政策的严格规定，当事人的协商是不能违背法律法规和地方政策的，否则，为无效行为。法律依据：2021年1月1日生效的《民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
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征迁协议是否有期限，是否有法律规定
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